V Everdeep jsou Biomy tematické skupiny Doly, z nichž každá nabízí svou vlastní úroveň obtížnosti, pravidla a výzvy. Jak postupujete z jedné Biom do další, Doly se stává delší, obtížnější a zavádí nové mechaniky. Musíte splnit všechny Doly v Biom, abyste odemkli další. Ne všechny Biomy se odemknou na začátku Událost, ale další se budou otevírat s postupem Událost.
Brzy Biomy:
Vhodné pro začátečníky Doly s menším počtem Důlní štoly a bez zvláštních pravidel. Tyto položky vám pomohou naučit se Událost a začít vydělávat Průkaz Everdeep XP.
Jádro Biomy:
Doly se prodlužuje a stává se obtížnějším, obsahuje více Důlní štoly a těžší postup.
Konec Biomy:
Oblasti v závěrečné fázi hry, které zavádějí pokročilé výzvy, včetně omezení Super manažer Základní a výrazně vyšší obtížnosti.