În Everdeep, Biomes sunt grupuri tematice de Mine, fiecare oferind propriul nivel de dificultate, reguli și provocări. Pe măsură ce treci de la un Biom la altul, Mine devin mai lungi, mai dificili și introduc noi mecanici. Trebuie să completezi toate Mine într-un Biom pentru a debloca următorul. Nu toate Biomes se deblochează la începutul Eveniment, dar vor apărea mai multe pe măsură ce Eveniment progresează.

Biomes timpuriu:

Mine ușor de utilizat pentru începători, cu mai puține Puțuri miniere și fără reguli speciale. Acestea te ajută să înveți Eveniment și să începi să câștigi Permis Everdeep XP.

Nucleul Biomes:

Mine devin mai lungi și mai dificile, având mai multe Puțuri miniere și o progresie mai dificilă.

Sfârșit Biomes:

Zone de la sfârșitul jocului care introduc provocări avansate, inclusiv restricții Super manager Elemental și dificultate semnificativ mai mare.